以“委”为例，比如，与产业有关的贸工局、科技局、高新园区领导小组办公室等5个部门被整合为科工贸信委，其他被整合的部门还有发展和改革委员会、规划和国土资源委员会、交通运输委员会等。
这番调整组合，使得原来的46个工作部门减少到31个， “瘦身”近1/3，80%的工作部门纳入整合范围，涉及的600多项行政审批事务减少近200项。即使不作调整的部门，在这次改革中也要按照转变职能的新要求，重新制定“三定”方案。
春江水暖鸭先知，深圳市民早就在自己的生活中感受着这种变革。比如一袋超市中摆放的虾，如何管控质量?质监部门负责生产环节，工商部门负责流通环节;如何安全监管?农业、质监、工商、卫生、食品药品等多个部门对食品链的不同环节或不同品种进行监管。但出了问题，找遍农业、质监、工商、卫生、食品药品等多个部门，不一定能找到管理主责部门，反而投诉无门。
改革后，新成立的市场监管局，统一承担由原工商局、质监局、知识产权局等部门的职责，以及卫生局餐饮环节的食品安全监管职责。这使负责食品安全监管的部门由5个减少为卫生、农业、市场监管3个部门，知识产权交由市场监管1个部门负责。
改革前，除了市场监督管理职能的多头化之外，其他部门的情况更为错综复杂。
以交通运输为例：一方面在地域上存在二元化管理，另一方面，城市市政道路和公路在种类上存在二元管理，市政道路由不同部门实行规划、建设、管养三分离体制，公路则是由另外一个部门实行三者一体化管理。
在执法方面，公路路政执法由交通部门承担，市政道路执法由城管综合执法队承担，既割裂了道路管理的整体性，也不利于城市化水平的提升。另外，道路管理与交通设施管理也是脱节的，道路上的路灯、绿化等附属设施由城管部门负责，但交通信号灯、交通标牌、标识、护栏等交通设施则由交通部门负责。
改革后新成立的交通运输委员会，统筹负责特区内外交通规划(设计)、建设、管养、执法以及运输管理，特区外的交通、公路也由原来的分级管理调整为市垂直管理。
为了减少改革带来的震荡，深圳自方案公布后，仅用39天就出台了改革后31个政府工作部门的“三定”方案，新部门正式挂牌运作。实际上，在改革方案公布前，深圳市纪委、市委组织部、市编办、市监察局就联合下发了《关于严明纪律切实保证政府机构改革顺利进行的通知》，就改革期间的政治纪律、机构编制工作纪律、组织人事纪律、财经纪律、保密纪律等作了明确规定。实践表明，此次改革的进程较为顺畅。
最大的改革是人的改革
改革的核心是“放权”。
新成立的市场监管局减少行政审批事项，大幅降低企业注册登记门槛，将有关技术性评审及事务性工作交给社会组织承担。
据深圳市编办统计，改革到现在，共取消、调整、转移284项职责及行政审批事项，其中，取消和调整行政审批事项194项，占当时623项的31%。同时，取消、调整和转移部门承担的一些评比表彰、统计考核、宣传培训、办展办会等90项事务性职责。
与此同时，一边发育社会组织，一边继续放权。22家进驻市行政服务大厅的单位的109项审批比改革前压缩了563个工作日，国税局、地税局、检验检疫局、外汇管理局、财政委、公安局等6个进驻部门的管理事项(大厅内)均为“即来即办”。
最大的改革是人的改革。
记者在深圳市编办还了解到，通过大部制改革，政府部门人员编制净减492名，其中公务员编制356名，雇员136名。局级干部，包括副局级干部编制几乎减少了四分之一。通过“瘦身”，大大减少了部门之间的职能交叉重叠，为政府的高效运作提供了重要保障。
