5月27日22时30分经罗湖口岸入境，深圳检验检疫局检疫人员引导两人进入持护照人员“专用查验区”进行检疫查验并作医学巡查时，发现女性患者当时面色潮红，神情倦怠。经医学询问并对其进行腋下体温复测，女性患者体温为37.4℃，男性患者为36.5℃。检疫人员依次将两人引导至负压隔离室作进一步的流行病学调查和医学排查。在留验调查过程中，检疫人员对两人再次作腋下体温复测，女性患者的体温升至38.6℃，男性患者的体温升至37.6℃;检疫人员同时发现两人均有咽部充血症状。深圳检验检疫局检疫人员决定将两人转交地方卫生部门进行隔离诊治。
深圳市急救中心接报后，安排专用120救护车将两名患者转送至深圳市第三人民医院。据商务车司机回忆，男患者乘坐其车辆时，已有感冒症状，自述是因下雨打球后着凉引起。
5月27日24时，深圳市疾病预防控制中心前往市第三人民医院对两名患者进行了流行病学调查。5月28日11时40分，市疾控中心报告2名患者实验室检测流感AH1N1核酸阳性。
5月28日上午11时，深圳市卫生局组织市甲型H1N1流感医疗救治专家组对这两名患者进行了会诊，专家组从流行病学、临床症状和病原学检测方面进行综合分析，认为该两名患者均符合卫生部《甲型H1N1流感诊疗方案(2009年试行第一版)》中关于甲型H1N1流感疑似病例的诊断标准。6名专家一致认为该两名患者为甲型H1N1流感疑似病例。深圳市卫生局按规定程序，将该两名患者的临床资料上报广东省卫生厅。
5月29日中午，广东省卫生厅专家组会诊判定，深圳市2例输入性甲型H1N1流感疑似病例为确诊病例。目前，两患者收治在第三人民医院，医院根据《甲型H1N1流感诊疗方案(2009年试行第一版)》，对该两名患者采取了积极的治疗措施。目前，两名患者病情稳定，其中一名患者体温已经恢复正常。其密切接触者中一人已送至深圳定点隔离点实施医学观察。
我市采取9大措施
加强甲流防控
深圳市出现2例输入性甲型H1N1流感病例，深圳市委、市政府对此情况高度重视，迅速组织市卫生、检疫、公安等部门加强联防联控，采取9大措施切实落实防控。
一是调查确定了与2名病例有过密切接触的10人，并向相关地区疾控中心通报密切接触者信息，相关地区落实防控措施。
二是市疾病预防控制中心已对患者进行了详细的流行病学调查，将在深的患者密切接触者1人送往我市隔离点进行集中医学观察;对密切接触者陈女士住宿的福民宾馆(深圳市罗湖区太宁路73号)所住楼层进行了消毒，并对与其近距离接触的2名服务人员登记造册，进行健康告知并实施医学观察。
三是各部门继续做好与检验检疫部门的配合，严把出入境检验检疫关，加强薄弱环节，全面落实各项措施。
四是加强流感疫情的监测和预警。完善流感疫情监测网络，扩大监测范围，提高监测能力。进一步强化疫情监测报告工作，严格按规定落实疫情报告制度，确保做到早发现、早报告、早隔离、早诊断、早治疗，增强防控工作透明度。
五是加强患者的临床救治工作。组织专家组进行会诊、轮值，积极落实救治方案，加强会诊研判。加强对该病例的医疗救治工作。
六是做好密切接触者的追踪与隔离观察。
七是科学运用各项干预措施。进一步做好健康教育，做好与公众的风险沟通，减少不必要的恐慌。
八是有针对性地加强重点场所、重点人群、重点区域的预防干预措施。积极主动，及早部署，特别是要加强学校防流感相关工作，保障高考、中考的顺利进行。
九是加强发热门诊工作及医院感染控制。
